Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
PTPN13Q12923 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
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