Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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CNN3Q15417 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CNN3Q15417 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CNN3Q15417 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNN3Q15417 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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