Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNN3Q15417 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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