Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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FOXD4Q12950 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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FOXD4Q12950 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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FOXD4Q12950 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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FOXD4Q12950 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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FOXD4Q12950 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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FOXD4Q12950 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD4Q12950 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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