Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRTO14522 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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