Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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FOXD4Q12950 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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FOXD4Q12950 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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FOXD4Q12950 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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FOXD4Q12950 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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