Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
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PTPN13Q12923 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
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PTPN13Q12923 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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PTPN13Q12923 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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PTPN13Q12923 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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PTPN13Q12923 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
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PTPN13Q12923 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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PTPN13Q12923 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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PTPN13Q12923 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPN13Q12923 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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