Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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GRIK3Q13003 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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GRIK3Q13003 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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GRIK3Q13003 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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GRIK3Q13003 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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GRIK3Q13003 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK3Q13003 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK3Q13003 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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