Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
FOXD4Q12950 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXD4Q12950 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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