Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNN3Q15417 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.4 ms