Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRTO14522 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207 ms