Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNN3Q15417 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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