Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF9Q13886 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.8 ms