Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CNN3Q15417 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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