Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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