Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.1 ms