Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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