Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRTO14522 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRTO14522 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRTO14522 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRTO14522 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRTO14522 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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PTPRTO14522 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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PTPRTO14522 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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PTPRTO14522 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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PTPRTO14522 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRTO14522 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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