Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPN13Q12923 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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