Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRTO14522 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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