Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPN13Q12923 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
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