Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXD4Q12950 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.8 ms