Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pacs2Q3V3Q7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms