Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms