Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRTO14522 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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