Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPN13Q12923 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
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