Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPN13Q12923 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPN13Q12923 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPN13Q12923 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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PTPN13Q12923 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPN13Q12923 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPN13Q12923 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPN13Q12923 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
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PTPN13Q12923 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPN13Q12923 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
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