Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPN13Q12923 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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