Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPRTO14522 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPRTO14522 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRTO14522 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRTO14522 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRTO14522 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRTO14522 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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