Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRTO14522 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRTO14522 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRTO14522 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRTO14522 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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PTPRTO14522 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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PTPRTO14522 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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PTPRTO14522 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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PTPRTO14522 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRTO14522 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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