Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ms4a4bQ9ES61 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ms4a4bQ9ES61 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ms4a4bQ9ES61 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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