Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPN13Q12923 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPN13Q12923 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
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