Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SardhQ99LB7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SardhQ99LB7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms