Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crlf3Q9Z2L7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crlf3Q9Z2L7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crlf3Q9Z2L7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crlf3Q9Z2L7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms