Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rps6ka4Q9Z2B9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rps6ka4Q9Z2B9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms