Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrknQ9WVS6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrknQ9WVS6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrknQ9WVS6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrknQ9WVS6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrknQ9WVS6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrknQ9WVS6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms