Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK4

Rfc2, Replication factor C subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc2Q9WUK4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfc2Q9WUK4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfc2Q9WUK4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfc2Q9WUK4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfc2Q9WUK4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms