Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp18Q9WTV6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp18Q9WTV6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp18Q9WTV6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp18Q9WTV6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms