Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Abcc6Q9R1S7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc6Q9R1S7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc6Q9R1S7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc6Q9R1S7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc6Q9R1S7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc6Q9R1S7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc6Q9R1S7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc6Q9R1S7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc6Q9R1S7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc6Q9R1S7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc6Q9R1S7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc6Q9R1S7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc6Q9R1S7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Abcc6Q9R1S7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Abcc6Q9R1S7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Abcc6Q9R1S7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc6Q9R1S7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc6Q9R1S7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms