Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma1Q9R1P4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psma1Q9R1P4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psma1Q9R1P4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Psma1Q9R1P4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms