Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hsf4Q9R0L1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hsf4Q9R0L1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hsf4Q9R0L1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms