Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tk2Q9R088 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tk2Q9R088 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tk2Q9R088 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tk2Q9R088 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tk2Q9R088 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms