Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ercc4Q9QZD4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc4Q9QZD4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc4Q9QZD4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ercc4Q9QZD4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc4Q9QZD4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms