Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ndrg3Q9QYF9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ndrg3Q9QYF9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ndrg3Q9QYF9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndrg3Q9QYF9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms