Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trem1Q9JKE2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trem1Q9JKE2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trem1Q9JKE2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trem1Q9JKE2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms