Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bgrlQ9JJU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bgrlQ9JJU8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bgrlQ9JJU8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms