Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpn1Q9JJN5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpn1Q9JJN5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpn1Q9JJN5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpn1Q9JJN5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms