Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI02

Scgb2b20, Secretoglobin family 2B member 20, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b20Q9JI02 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scgb2b20Q9JI02 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scgb2b20Q9JI02 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scgb2b20Q9JI02 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scgb2b20Q9JI02 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scgb2b20Q9JI02 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scgb2b20Q9JI02 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scgb2b20Q9JI02 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scgb2b20Q9JI02 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms