Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PalldQ9ET54 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PalldQ9ET54 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PalldQ9ET54 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PalldQ9ET54 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PalldQ9ET54 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PalldQ9ET54 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PalldQ9ET54 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PalldQ9ET54 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PalldQ9ET54 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PalldQ9ET54 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PalldQ9ET54 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PalldQ9ET54 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PalldQ9ET54 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PalldQ9ET54 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms