Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Wdr61Q9ERF3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Wdr61Q9ERF3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr61Q9ERF3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Wdr61Q9ERF3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Wdr61Q9ERF3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Wdr61Q9ERF3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr61Q9ERF3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr61Q9ERF3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr61Q9ERF3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr61Q9ERF3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr61Q9ERF3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms